滨州市人民检察院下辖滨城、沾化、惠民、阳信、无棣、博兴、邹平经济开发区等8个县（市、区）检察院，市院机关下设办公室、政治部、侦查监督处、公诉处、反贪污贿赂局、职务犯罪大要案侦查指挥中心办公室、反渎职侵权局、监所检察处、民事行政检察处、控告申诉检察处、职务犯罪预防处、检察技术处、法律政策研究室、警务处、行政装备处、监察处、机关党委、大指办、驻所检察室、人民监督员办公室、信息管理办公室、检务督察室、派驻高新区检察室、派驻北海新区检察室等24个内设机构。