细菌脱硫（Bacterial desulfurization）又称生物浸硫法，即利用嗜硫杆菌能够加速黄铁矿氧化而达到脱硫的过程。脱硫速度与供氧量、水量、水质、温度和酸碱度有关，与黄铁矿的粒度、晶体亦有关。