小瓮猪笼草是菲律宾棉兰老岛（Mindanao）汉密吉伊坦山（Mount Hamiguitan）特有的热带食虫植物。其为高地猪笼草，生长于海拔1100~1635 m的地区。其种加词来源于希腊语和拉丁语，“mikros”在希腊语中意为“小的”，“amphora”在拉丁语中意为“瓮”，指其体型的矮小。