短鳍鱼龙是鱼龙目温多雷鱼龙科扁鳍鱼龙亚科的一属，生存于侏罗纪晚期，化石发现于英格兰与俄罗斯的欧洲部分。在1922年，弗雷德里克·冯·休尼（Friedrich von Huene）命名这个新属，模式种是Brachypterygius extremus。正模标本发现于英格兰巴斯的启莫里黏土层，地质年代为侏罗纪晚期的启莫里阶。