甘肃狼鳍鱼体呈纺锤形或长纺锤形，身体最高部居于腹鳍起点处，体高为全长的1/4。头短，吻钝，头长稍大于头高，而小于体高，约为全长的1/5。头部膜质骨具有薄闪光质层。