双柏县卫生局负责贯彻执行国家和省州卫生改革与发展的方针政策；拟订卫生改革与发展目标、规划和政策，拟订医药卫生体制改革相关配套方案并组织实施；统筹规划与协调卫生资源配置。制定区域卫生规划并组织实施；承担新型农村合作医疗综合管理，拟订新型农村合作医疗政策并指导实施。