六安市环境保护局，是六安市环境保护工作管理职能部门，机关内设办公室（宣教法规科）、环境影响评价科（行政审批服务科）、总量控制科（污染防治科）、自然生态保护科、机关党委，下设六安市环境监测中心站、六安市环境监察支队、六安市环保科研所、六安市机动车污染管理办公室、六安市环保产业中心、六安市环境信息监控中心等事业单位。