德州市人民检察院下辖德城、乐陵、禹城、平原、陵县、齐河、夏津、武城、临邑、宁津、庆云等11个县（市、区）检察院，市院机关下设办公室、政治部、侦查监督处、公诉处、公诉二处、反贪污贿赂局、反渎职侵权局、监所检察处、民事行政检察处、控告申诉检察处、职务犯罪预防处、检察技术处、法律政策研究室、警务处、行政装备处、职务犯罪大要案侦查指挥中心办公室、离退休干部处、机关党委、监察处、人民监督员办公室等19个内设机构。