结构镜质体是指在普通显微镜下具有植物细胞结构的镜质组组分，其细胞壁部分称为结构镜质体。其中细胞腔开放成近圆形的称结构镜质体1；细胞壁强烈膨胀，细胞腔闭合成为断续线条的称结构镜质体2。细胞腔往往被无结构镜质体、树脂体、微粒体或粘土矿物所充填。结构镜质体按原来植物属分为科达木结构镜质体、真菌结构镜质体、木质结构镜质体、鳞木结构镜质体和封印木结构镜质体五个变种。