琼库勒乡位于且末县城东南城乡结合部，北与县城接壤，南与兵团农二师工程支队相邻，东隔车尔臣河与阿热勒乡相望，西临革命大渠与托格拉克勒克乡临界。315国道横穿本乡，乡政府驻地距县城2.5公里，境内有距今1300年前盛唐时期的来勒利克古城遗址，全乡总面积44平方千米。