甘河子镇位于阜康市区以东37公里，地处天山东段博格达峰北麓，天龙南山北坡，准噶尔盆地东南缘，四周与上户沟乡相邻。东部与吉木萨尔县毗邻，吐—乌—大高等级公路距镇区3.7公里，S303线横穿全境，乌甘铁路横卧镇南。