溃疡性肠炎是由大肠梭状芽胞杆菌（clostridium colinum，又称肠梭菌）引起的。该菌呈杆状，为革兰氏染色阳性；菌体长3～4μm，宽1μm，平直或稍弯，两端钝圆，芽胞较菌体小，位于菌体近端，人工培养时，仅少数菌体可形成芽胞。