水农业污染源是指在农业生产过程中对水域环境造成有害影响的农田和各种农业措施。不合理施用化肥、农药和不合理的污水灌溉和牲畜养殖，会造成土壤和农药、化肥、重金属和病原体等的污染；同时将水及其径流和渗流，又把农田、牧场、养殖场已给付产品加工厂等附近土壤中这些残留的污染物带入水体，使水域的水质恶化。