上海昆剧团前身为上海青年京昆剧团，成立于1961年8月，1978年改现名，由京昆艺术大师俞振飞为首任团长。成员大部来自上海戏曲学校一、二、三班毕业生。2019年11月，《国家级非物质文化遗产代表性项目保护单位名单》公布，上海昆剧团获“昆曲”项目保护单位资格。