澎湖镇又名澎湖水师镇为台湾清治时期之台湾建省後，于1886年建立的台湾澎湖地区最高军事单位，其主官为澎湖镇总兵官（或称澎湖镇总兵、澎湖水师镇总兵）。澎湖镇的建立与中法战争中，俗称西仔反的台湾相关战事有极大关系。因为在此战役末期中，法国将领孤拔轻易攻占澎湖。