位于大岗山山麓，由于庙基系坐落于「莲花穴」上，乃以此穴名之「莲」与超峰寺「峰」字而名。莲峰寺建于民国初年(1912)，是由超峰寺僧开吉师有感古寺僧众繁多，乃领母（永贵尼师）率妹（开善尼师）于现址山下一百公尺处搭建茅蓬数间，供奉一佛二菩萨(一佛即指「释迦佛」，二菩萨即指「文殊菩萨」、「普贤菩萨」)，为莲峰寺创庙之始。