洞穴生物指的是在无光及弱光、相对恒温和潮湿的洞穴环境中生长、发育的生物群。根据生物的四界分类法，洞穴生物可划分为原核生物、真菌、低等植物及动物。原核生物包括蓝藻和细菌，蓝藻大多分布在洞口或弱光带，细菌分自养型和异养型。在洞穴深部生活的是化能自养型细菌和异养型细菌，光能自养型细菌生活在有光地带，真菌同异养型的细菌，靠分解动物的尸体和排泄的粪便为食。洞穴植物主要为分布在洞口和弱光带的低等植物，如蕨类、苔藓、地衣及藻类等，在一些旅游洞穴的深部，也生长有灯光植物。20世纪中叶，在地质学、洞穴学和生物学的基础上，发展形成了一门相对独立的学科一洞穴生物学。