薄囊蕨纲（学名：Leptosporangiopsida）的孢子囊壁薄，由一层细胞组成。具有各式发育完全的环带，每个孢子囊的发生是由一个细胞发育而来，孢子囊通常聚集形成孢子囊群，着生在孢子叶的背面、边缘或特化的孢子叶的边缘，囊群盖有或无，孢子少，大多数种类为同型孢子，少数水生蕨类形成孢子果，孢子囊包被在孢子果内，具有异形孢子。本纲下分为真蕨目（又称水龙骨目）、苹目和槐叶苹目三个目。