内在底栖生物 endobiosis 在底栖生物中栖息于基底内部的生物的总称。可以分为刻削硬的基质进行穿孔的种类（如凿船虫）、挖掘沙泥基质的种类（如穴居性蟹类）、推开泥沙而潜伏的挖掘型的种类（如沙巽，蚯蚓）、进入沙粒间空隙的种类（如硅藻类、线虫类）、钻入岩石的裂缝、坑处的种类（如毛槊），还有潜藏在其他动物巢穴的（如长脆鳞虫种类）隐孔生物群。