投资部门结构是指投资资金在各部门之间的分配比例关系。国民经济可以分为众多的部门，主要有两大类，即物质生产部门和非物质生产部门。物质生产部门又可分为生产资料生产部门和消费资料生产部门，生产资料生产部门和消费资料生产部门还可进一步细分。把投资资金分配干不同的部门，形成不同层次的投资部门结构。