根据《中共肇庆市委 肇庆市人民政府〈关于印发肇庆市人民政府机构改革方案〉的通知》（肇发〔2009〕24号），设立肇庆市交通运输局，为市人民政府工作部门。为正县级机关单位。负责全市道路运输（含城市公共交通运输）、水路运输的行业管理。承担营业性客货运输站场、机动车维修、机动车驾驶培训、运输从业人员培训等道路运输相关业务的行业管理。设有9个内设机构，9个直属单位。