绍兴市国家税务局成立于1994年。1997年9月，浙江省国、地税机构进一步分设后，正式独立对外开展工作，负责和主管绍兴市范围内中央税、中央和地方共享税及国家指定的税种的征收管理工作，管辖绍兴县、诸暨市、上虞市、嵊州市和新昌县等5个县（市）国税局，市局本级直属单位有直属分局、滨海分局、稽查局和车购税分局，下属事业单位有信息中心和机关服务中心。2018年7月5日，新组建的国家税务总局绍兴市税务局挂牌成立，标志着原绍兴市国家税务局、绍兴市地方税务局正式合并。