杭州海关成立于1979年1月2日，直属海关总署，并接受浙江省人民政府监督指导。为厅局级机构，1984年前业务管辖范围为浙江省全境及其所辖海域，1995年1月，宁波海关从杭州海关分离，直属海关总署领导。 目前，杭州海关业务管辖范围为，除宁波地区以外的浙江省全境及其所辖海域，辖区陆域面积9.61万平方公里，大陆海岸线长1225公里，拥有国家开放口岸16个。内设缉私局（下设8个处室）、政治部，16个职能处室、2个事业单位。下辖12个隶属海关，8个缉私分局，5个驻外办事处。另有17个隶属海关驻外机构。