贵港市地方税务局机关内设办公室、计财科、人教科、监察室、法规科、征管科、税政科、所得税科共8个行政科室和计算机信息中心、机关后勤服务中心2个事业单位。2018年7月5日，国家税务总局贵港市税务局挂牌成立，标志着原贵港市国家税务局、原贵港市地方税务局正式合并。