信阳市环境保护局是人民政府的职能部门，组织拟订并监督实施重点区域、流域污染防治规划和饮用水源地环境保护规划，参与制定信阳市主体功能区划。2018年12月，组建市生态环境局。将市环境保护局的职责，以及市发展和改革委员会的应对气候变化和减排职责，市国土资源局的监督防止地下水污染职责，市水利局的编制水功能区划、流域水环境保护、排污口设置管理职责，市农业局的监督指导农业面源污染治理职责等整合，组建市生态环境局，作为市政府工作部门。不再保留市环境保护局。