新疆维吾尔自治区工商行政管理局是自治区人民政府主管市场监督管理和行政执法的综合部门。目前全系统共有干部职工近万人，县以上工商局122个，其中自治区工商局直属开发区分局（处级）2个，地，州，市工商局21个，县，市（区）工商局（分局）103个，按经济区域设置的工商所389个。为适应社会主义市场经济的发展，从1999年起，自治区工商系统实行省以下垂直管理。2017年11月17日，获第五届全国文明单位称号。