水利局内设办公室、财务股、农水股、工程股、水保股、水政股、移民办公室、防汛抗旱办公室等股室，下辖洛南、洛北、马店三个渠道管理所、大沟口水库管理所、河道管理所、水土保持预防监督办公室、水资源管理委员会办公室、抗旱服务队、计划节约用水办公室和田林水保技术推广站10个二级机构。