临清市农业局成立于1950年，成立之初称临清镇农建科，1984年三月改为临清市农牧渔业局，1988年1月机构改革时，撤农牧渔业局，分别成立农技、畜牧、水产三个中心，1996年2月恢复农业局，为正科级单位，为政府组成部门。