连江县政府教育局是马祖“连江县政府”工作部门，管辖区域为台湾当局实际控制的连江县马祖乡，台湾当局对马祖乡的行政区划为连江县，划分为南竿乡、北竿乡、东引乡和莒光乡4乡，是实际主管马祖地区的教育行政部门。