根据《中共江苏省委、江苏省人民政府关于印发<苏州市人民政府机构改革方案>的通知》（苏委〔2009〕413号）和《中共苏州市委、苏州市人民政府关于印发<苏州市人民政府机构改革实施意见>的通知》（苏发〔2009〕56号），设立苏州市交通运输局，挂苏州市港口管理局牌子，为市政府工作部门，正处级建制。2019年1月，苏州市交通运输管理局进行机构改革。