吉林市国家税务局成立于1994年9月。吉林市国家税务局负责辖区内纳税人的中央税、中央与地方共享税的税收征管工作。2018年7月5日上午10时，国家税务总局吉林市税务局正式挂牌成立，吉林市国家税务局和吉林市地方税务局正式合并。