扬州市地方税务局是1994年9月国、地税分设时成立，其中1994.9.1－1998.12.31隶属于扬州市人民政府，1999.1.1起隶属于江苏省地方税务局。现下辖宝应、高邮、江都、邗江、仪征5个县（市、区）地方税务局，全系统共有基层分局58个、办税服务厅37 个，市局机关内设10个职能处室、2个党群机构和1个事业单位。全系统现有干部职工985人（其中市区251人），大专以上学历比例达到95.1%（其中市局大专以上学历比例达98.4%），党员比例占80.3%。2018年7月5日，新组建的国家税务总局扬州市税务局挂牌成立，标志着原扬州市国家税务局、扬州市地方税务局正式合并。