黄阁中学创办于1958年，建校至今已有50多年的历史。2001年，为适应教育事业发展的需要，镇政府斥资3000多万元，在原黄阁中学旧址上，把原镇内的另一所中学（黄阁二中）合并成新的黄阁中学，从而扩大了办学规模，有效地优化了教育资源，教育教学质量逐年提高。2005年，学校通过了广州市人民政府教育督导室督导验收，成为广州市一级学校。