魏家店村位于北京市顺义区木林镇西南部，为镇域最南部村庄。东北接蒋各庄村；西北接北府村；北到东沿头村；东邻东府村。村域面积约1.3平方公里，全村常住人口970人。地势西高东低，西临呼奴山。平均海拔37米，高差1米。顺密路由南向北纵贯该村。