马鹿沟镇位于吉林省东南部，长白山主峰南麓，鸭绿江最上游，北与抚松县漫江镇接壤，西与长白县金华乡毗邻，东南两面与朝鲜民主主义共和国两江道的一市二郡隔江相望。