阴道纵膈由于双侧中肾旁管下段融合后，其中隔未消失或未完全消失所致。因其中隔消失程度不同而分为完全性阴道纵隔及不完全性阴道纵隔。完全性阴道纵隔常合并双子宫双阴道。有时纵隔偏向一侧形成阴道斜隔。