蛋白质，或是多肽，是一条氨基酸的链。当合成蛋白质时，20种不同的氨基酸会合并成为蛋白质。氨基酸的翻译后修饰会附在蛋白质其他的生物化学官能团（如醋酸盐、磷酸盐、不同的脂类及碳水化合物）、改变氨基酸的化学性质，或是造成结构的改变（如建立双硫键），来扩阔蛋白质的功能。再者，酶可以从蛋白质的N末端移除氨基酸，或从中间将肽链剪开。举例来说，胰岛素是肽的激素，它会在建立双硫键后被剪开两次，并在链的中间移走多肽前体，而形成的蛋白质包含了两条以双硫键连接的多肽链。