内胚层间是囊胚期植物极细胞向内陷入，形成两层细胞。外层的为外胚层，内陷的一层为内胚层，内胚层包围的腔为原肠腔，原肠空与外界相通的孔为胚孔，中胚层由胚孔部分向内卷入，介入内外胚层间。