藻胆蛋白是由脱辅基蛋白(apoprotein) 和藻胆素(phycobilin,PCB)通过一个或两个硫醚键共价连接而成的。在螺旋藻藻胆蛋白中，只发现有一种藻胆素，即藻蓝素。藻胆蛋白是某些藻类特有的重要捕光色蛋白，早在上个世纪初，就曾报道在蓝藻和红藻中存在强烈荧光性的红色、紫罗蓝色和蓝色蛋白质。科学研究表明，藻胆蛋白是一种既可以作为天然色素用于食品、化妆品、染料等工业上，也可制成荧光试剂，用于临床医学诊断和免疫化学及生物工程等研究领域中。另外，还可以制成食品和药品用于医疗保健上，应用范围广阔，具有很高的开发、利用价值。