免疫学和遗传学交叉的边缘学科，主要研究免疫系统的结构和功能如免疫应答、抗体的多样性等的遗传基础。此外，也应用免疫学的方法来识别个体间的遗传差异（如血型、表面抗原等）以作为遗传规律分析的指标。免疫遗传学是现代医学临床实践的重要理论基础之一，是输血、器官移植、胎母不相容和亲子鉴定的理论基础，对阐明免疫系统的演化、人种差异和生物进化也有重要意义。