为支配免疫反应性的基因的总称。广义的也包括免疫球蛋白基因，但一般指在它之外的基因。最重要的是指在主要组织相容性抗原基因复合体（MHC）内存在的Ir基因（Ir genes）。表达lr gene的方式多种多样，支配阻遏细胞和辅助细胞（helper cell）机能的表达或由巨噬细胞向T细胞提供抗原。在这MHC内的Ir基因之外，也有决定来源于在性染色体上存在的来源于B细胞的辅助细胞的因子的受容体，或调节B细胞分化的基因等。