穴丝荠，多年生草本。茎多叉状分枝，上部呈匍匐状，老茎覆盖枯萎残存的叶片；当年茎在开花前高5—6厘米，茎上着生2—4叶，基部叶呈莲座状；茎和叶子均有细长单毛及分叉毛。基生叶倒卵形，长10一15毫米，宽4一5毫米，茎生叶形小，边缘均具缘毛。总状花序顶生，初呈伞房状，花多数；花萼开展，萼片近圆形至椭圆形