短鳄齿鱼体延长，稍侧扁。口大，斜裂。上颌骨大部份外露，末端延伸超过眼的后缘；前颌骨前缘具凹陷处；下颌突出。颌骨外列齿细长，呈犬齿状，可倒伏；内列齿细小，绒毛状；锄骨具齿，腭骨无齿。