在厌氧条件下，微生物分解糖产生丁酸的过程称为丁酸发酵。在自然界中该过程广泛存在。例如，纤维素、半纤维素、淀粉、果胶物质及简单糖类，在不通气条件下都能进行丁酸类型的发酵。引起发酵的主要微生物是专性厌氧性的丁酸细菌(Clostridum butyricum)，它生存于植物体表、土壤、污水及污泥中。