真菌纤维素指具有分解纤维素能力的真菌分解的纤维素。纤维素很难被分解，已知除真菌外，只有纤维素分解细菌及少数软体动物能分解它。在真菌中，从它们的异养生活实际过程中，可以看到许多种属能起这种作用，已知主要是野生型的曲霉、青霉、毛壳属（Chaetomium）、镰孢属（Fusarium）、木霉属（Trichoderma）、漆斑菌属（Myrothecium），特别是所谓植物寄生菌和腐朽木材的真菌，如蜡伞属（Pleurotus）、奇果菌属（Grifola）、耙菌属（Irpex）、层孔菌（Fom－es）等，它们会造成褐色腐斑。据认为，它们分解木材的主要因素是它们可形成纤维素酶。