生物机器，顾名思义指的是能像机器一样生产产品的生物体。比如说牛吃草而生产牛奶（畜牧业的生物机器、动物生物机器），苹果树从土壤中吸收营养在阳光雨露下产出苹果（农林业的生物机器、植物生物机器），微生物在工业发酵的条件下产出工业发酵目的产物（工业的生物机器、微生物生物机器、细胞机器）。