《生物工程学报》创刊于1985年，是由中国科学院主管，由中国科学院微生物研究所和中国微生物学会主办的学术期刊。据2018年3月《生物工程学报》编辑部官网显示，《生物工程学报》第五届编辑委员会拥有顾问1人、编委79人、编辑部成员2人。据2018年3月中国知网显示，《生物工程学报》共出版文献5346篇、总下载1143314次、总被引54361次、（2017版）复合影响因子为0.977、（2017版）综合影响因子为0.587。