休眠孢子囊(resting sporangium) 是指一些鞭毛菌有性生殖产生的厚壁休眠结构。休眠后萌发释放出多个游动孢子。不同种类鞭毛菌形成休眠孢子囊的方式及其萌发发育等各有区别。