青海省海南州气象局设机关科室3个：办公室、人事政工科、业务科；直属事业单位4个：气象台、防护雷电中心、科技服务中心、驻宁办；所辖7个县气象局（站），其中国家基准站1个（兴海）、国家基本站3个（共和、贵德、贵南）、国家一般站3个（同德、江西沟、河卡）。