流域生态学以流域为研究单元，应用等级嵌块动态（Hierarchial patch dynamics）理论，研究流域内高地、沿岸带、水体间的信息、能量、物质变动规律。有学者将生态系统中的几个互相联系的基本部分（即数据采集与处理，信息分析、解释，建模与预测，专家系统与优化管理系统）所组成的有机整体称为生态信息系统，将有关这一研究的学科定义为信息生态学、并认为它是生态系统理论与系统生态学的新发展。而流域生态学作为淡水生态学、系统生态学和景观生态学间的交叉学科，亦应包括基本的信息生态学内容 。